東欧の小国・東スラブ共和国では反政府軍による独立運動が発生し
今や戦乱の世と化していた。
その戦場へ生物兵器「B.O.W.」が投入された情報を受け
アメリカ合衆国大統領直属エージェントのレオン・S・ケネディは単独潜入するが
その直後に政府事情によりアメリカが突如東スラブからの撤退を決めたため
レオンにも退去命令が下る。
しかし、レオンはB.O.W.がもたらす悲劇の連鎖を食い止めるべく
命令を無視して戦場へ身を投じる。
こうして、レオンの最も過酷で最悪の1日が始まった。
時系列的にはゲーム『バイオハザード5』と『バイオハザード6』の間の話になる。