CHAPTER 5はAMADA社に向かったダン達は襲い来るシノビを倒さないと進めないので先に倒そう(スピードや回避力が高いのでアサルトライフルで撃ち続けよう)。この場所はナノマシンまたは武器を強化できる端末ショップが利用できないのでメデューサの戦い前にはスキルの見直しをしてから行う。
弱点の動力源を撃って、隠れた場合は3つの腕に狙う太い動力源を撃てば壊れ、3つ停止すれば腕へ登れるので、放電しているヵ所はあたらないように登ろう(当たると動けなくなる)。登っている間はサーチされて銃撃するほか、通れないバリアがある時は時間を経過すれば通してくれる。腕はこの後にぶらぶらするため、飛び移れば昇降機を探すことがあるので他メンバーを助けよう。動力源はランダムに回転し、バリアを壊さないと狙ってくれないので雑魚敵にかまうな(相撃ち狙いやメンバーの助けは行いたい)。弾がなくなるまたは救急キットが1つもない場合なら落ちているので拾うことも重要。倒した後、シャッターに敵が潜んでいるので中には盾を持つ敵も登場する。しばらく新堂さんがトイレに行ってる間は銃撃を行い、トイレタイムが終わればまた戦闘できるので粘ろう。会話して選択肢を選んだ後に再び戦闘でき、この先の非常階段を上って敵と戦闘に粘れば端末ショップが行えるので何か買います。大型シャッターに出迎える前には狙撃を狙う敵と盾を持つ敵もいるのでダメージを食らい続けないようにスパークショットで怯ませよう。モニタールームに到着したらメンバーを2人選んで進んでいこう。
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