3年前、初代ケーまるは幾多の戦いを経てポケモントレーナーに対する失望を強め、その腐敗の根源たるオーキド博士に対し反乱の狼煙を上げた。
彼は自分以外のポケモントレーナーを粛清するため、大量殺戮兵器アクマイトによるポケモントレーナー抹殺計画を実施する。
早速、アクマイトのプロトタイプを作るも、かつてのポケモンリーグチャンピオンを中心に構成する“四天王”は、
いち早くケーまるの動向を察知し、計画を阻止すべく応戦した。
それにより、彼はアクマイトの試作機を38番道路の草むらに隠し、その行方をくらました....
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